有機化合物的氟化有以下幾種方法：①選擇性氟化。用堿金屬的氟化物或銻、汞、銀的氟化物，可將鹵代烷或磺酸酯轉化為氟代烷，反應一般在無水極性介質中進行；也可用五氯化銻等作催化劑，在無水氟化氫中進行氟化。四氟化硫可作為將羥基、羰基和羧基分別轉化為一氟代烷基、二氟次甲基和三氟甲基的專一性試劑，必要時可添加氟化氫、三氟化硼等催化劑。②全氟化。元素氟可將有機化合物中的多重鍵用氟飽和并將碳-氫鍵全部轉化為碳-氟鍵。由于反應大量放熱，常伴隨各種斷鍵和一些偶合、聚合反應，產物極為復雜。高價金屬氟化物如三氟化鈷為較元素氟溫和的氟化劑，可從萘和四氫萘的混合物制取全氟萘烷。其他類似的氟化劑為二氟化銀、三氟化錳等。③電化氟化。將有機化合物溶于無水氟化氫中，必要時添加少量導電體，于低壓下進行電化反應 ，在陰極放出氫 ，化合物中的碳-氫鍵在陽極轉化為碳-氟鍵，多重鍵被氟飽和，并發生一些降解反應。這是制備全氟有機化合物的好方法之一。
很多有機氟化合物有重要的用途。例如，聚四氟乙烯可作人造關節的部件，長期用于人體內；全氟萘烷和全氟三丙胺的混合乳劑可作為氟碳代血液；全氟環丁烷可作食品發泡劑；全氟三丁胺乳劑可替換大白鼠的全部血液而使動物仍能正常存活。
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